银杏果主要含黄酮类，其主要成分为山奈黄素、槲皮素、芦丁、白果素、银杏素、穗花双黄酮等。尚含奎宁酸等有机酸、银杏酸（ginkgolic acid）、银杏酚（bilobol）等酚类，以及银杏醇（ginnol）、蛋白质、脂肪、碳水化合物、钙、磷、铁、胡萝卜素等。其毒性成分为白果酚。
银杏果种子含少量氰甙、赤霉素和动力精样物质。内胚乳中还分离出两种核糖核酸酶。一般组成为：蛋白质6.4%、脂肪2.4%、碳水化物36%，糖6%(主要为蔗糖)，钙10毫克、磷218毫克、铁1毫克%，胡萝卜素320微克、核黄素50微克% ，以及多种氨基酸。
银杏果外种皮含有毒成分白果酸、氢化白果酸、氢化白果亚酸、白果酚和白果醇。尚含天门冬素、甲酸、丙酸、丁酸、辛酸、廿九烷醇-10等。
花粉含多种氨基酸、谷氨酰胺、天门冬素、蛋白质、柠檬酸、蔗糖等。雄花含棉子糖可达鲜重的4%。
银杏果果仁含有多种营养元素，除淀粉、蛋白质、脂肪、糖类之外，还含有维生素 c ，核黄素、胡萝卜素、钙、磷、铁、钾、镁等微量元素，以及银杏酸、白果酚、五碳多糖、脂固醇等成分。具有益肺气、治咳喘、止带虫、缩小便、平皴皱、护血管、增加血流量等食疗作用和医用效果。
根据现代医学研究，银杏还具有通畅血管、改善大脑功能、延缓老年人大脑衰老、增强记忆能力、治疗老年痴呆症和脑供血不足等功效，银杏抗衰老的本领。在德国和法国的科学影响很大。除此以外，银杏还可以保护肝脏、减少心律不齐、防止过敏反应中致命性的支气管收缩，还可以应用于对付哮喘、移植排异、心肌梗塞、中风、器官保护和透析。
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