银杏育苗圃地整理，首先提早。最好能在年前秋季翻挖土块(不打碎)，再于次年春季筑床。这样做，不仅有利于土壤的进一步风化，以利于部分不溶性养分的释放，也有利于冻杀蛴螬、地老虎等在土壤中越冬的害虫。
第二要够深。整地深度一般应当大于20厘米。银杏育苗后，至少要在地里生长二年，所以，一定要清除地里所有的杂物，特别是茅草的地下茎或竹鞭之类，以及易于根蘖的刺槐根系等，都要彻底清除，以免为今后管理带来不便。
严冬一过，就要及时施肥，筑床。一般采用边施肥边筑床的方式准备播种床。具体做法与当地气候条件有关。干旱的北方，宜采用平床或低床，以尽可能减少土壤水分的蒸发。多雨的南方，应当筑高床育苗以改善排水和操作条件。
采用高床育苗，结合施肥筑床的具体做法是：先耙平地面，在要筑床的地面两边，拉上线绳，以确定床面宽度范围，再铺上猪栏肥或其他有机肥料，铺匀后，用沟间位置的土，覆盖住肥料，覆土厚度3—5厘米。土面耙平，即能用于播种银杏种子或移栽银杏芽苗。
采用平床育苗，可以先将床面位置的土扒开后施肥，再将扒出来的土翻入床面就行。扒开土面的深度，只要有5厘米左右即可。如果扒开土面超过l0厘米，回土后就能筑成低于地面的苗床。降水量小于800毫米的北方育苗，需要采用漫水灌溉的，就应当采用低床育苗。
银杏苗床，一般需要遮荫。特别是气候炎热的地区育苗，苗床的方向，也会直接影响到遮荫棚的架设及其效果。通常条件下，苗床以东西走向为好。这样做，有利于调节和控制遮荫的程度和部位。
银杏种子较大，又富含养分，播种或移栽芽苗后，都会招引鸟兽危害。特别是施用饼肥后立即播种，饼粕的香味很快就能招来大批鸟兽，取食或搬走种子，这也会造成育苗的失败。所以，施肥和筑床都要提早进行。播种或移栽后还要采取相应的防治措施，以驱赶鸟兽。实践证明：只要提前筑床，筑床后每隔一周撒少许毒饵，对于保证播种或移栽育苗的成功是相当有效的。
为了防止人畜危害，必要时银杏圃地还应围上篱笆。